O Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão, conforme o art. 18 do texto estatutário, é constituído pelos seguintes órgãos:

- Presidência, exercida pelo Reitor e, nas suas faltas ou impedimentos eventuais, por seu substituto legal;

- Plenário, integrado pelos conselheiros presentes às reuniões regularmente convocadas e instaladas;

- Câmaras acadêmicas, definidas pela Resolução Complementar do Conselho Universitário n^o 02/1999, mediante proposta do Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão. São presididas pelos respectivos Pró-Reitores e integradas por conselheiros eleitos pelo Plenário, dentre seus membros, cada um dos quais pode  participar de até duas Câmaras acadêmicas;

- Comissões, constituídas pelo Plenário, para estudo de matérias especiais;